Επιστρέφει στην Ελλάδα το 1838 και διδάσκει στο πανεπιστήμιο της Αθήνας. Στη συνέχεια υπηρετεί στο δικαστικό σώμα, ως αντιεισαγγελέας του Αρείου Πάγου, για να τον κερδίσει στη συνέχεια η πολιτική. Υπηρετεί ως υπουργός σε διάφορα υπουργεία από το 1854 ως το 1882, γίνεται Πρόεδρος της Βουλής και τελειώνει την καρριέρα του ως Διοικητής της Τράπεζας της Ελλάδος.
Ως συγγραφέας ο Καλλιγάς άφησε πλήθος μελετών σχετικά με τα νομικά και την ιστορία. Το "Θάνος Βλέκας" είναι το μόνο του μυθιστόρημα, το οποίο δημοσιεύθηκε για πρώτη φορά σε συνέχειες στο περιοδικό "Πανδώρα" το 1885.
